ErlangのDownloads から R12B-3 を落として ./configure したら↓こんなのでました。
********************************************************************* ********************** APPLICATIONS DISABLED ********************** ********************************************************************* odbc : ODBC library - link check failed *********************************************************************
こちらで紹介されてるままにlib/odbc/configure.inにパッチを当てて、lib/odbc/ ディレクトリでautoconfコマンドを実行してconfigureファイルを作成。これでwarning出なくなりました。
MacPortsの中の人は偉大ですね〜。